Léčba výrazných traumatických událostí (přepadení, týrání, autonehoda…) prostřednictvím EMDR je založena na hypotéze, že každá taková událost má svoji fyziologickou komponentu a po každém takovém zážitku dojde k narušení
excitační/inhibiční rovnováhy. Neschopnost zpracovat takový prožitek pokračuje psychopatologií, jako je posttraumatická stresová porucha s neodbytnými všepronikajícími invazivními myšlenkami, atakami úzkosti, paniky, flash backy a nočními můrami.
Metodologie EMDR jako forma zrychleného informačního zpracování může velmi rychle a efektivně "zmrazenou" informaci či prožitek odblokovat, což vede k odpadnutí traumatické symptomatologie, a umožňuje znovunastolení rovnováhy.